“呀！，黑木博士，这么急有什么事？”大木说道。“我这的研究有了突破性的进展，已经发报告了，正好让叶辉回来跟着学习一下。”黑木回道。
“哦，研究成功了。那真是恭喜，有机会到你那里参观一下。”“没问题，欢迎你的到来，大木博士。”两人交谈完，叶辉就被大木博士叫车送到了港口坐上了开往丰缘地区的船。
到达凯那市，下船后，叶辉看到了在港口处挥手的阿兰，“这，叶辉，我们从这走。”阿兰接到叶辉后带着叶辉做草飞龙飞空到暮水镇的研究所。
到了研究所休息一天，叶辉就被带着来到岩石边的黑木研究所。进去以后就能看到这里被改造成了特殊的岩洞环境，在水边还能看到菊石兽在喝水，显然化石复活机研究成功了。
进到了加工几层，看着就像是未来科技的防御基地里似的研究所，叶辉终于看到了黑木，说：“黑木叔，你这基地可真严实。”黑木说：“叶辉，回来了就好，这不是因为古代化石j-i,ng灵嘛，有的还好，有的就很暴躁。你在外面看的就是在这里生活一段时间的复活j-i,ng灵中性格比较温和的，比较凶的都暂时收在j-i,ng灵球里，等有时间了在慢慢驯服。对了，和我来。”
黑木，带着叶辉经过了几道门的验证进了一间为3号的研究室。叶辉看着前面两人惊讶道：“这是大吾和源治先生。”听到声音的两人回过头来，大吾说：“是叶辉啊，旅行回来了。”
黑木介绍道：“这两人源治天王负责海上海下的警戒，保证研究所的安全，冠军大吾来帮忙压制刚复活的暴躁j-i,ng灵。叶辉，好好看看，这就是最后的复活了。”
黑木启动了化石复活装置，一阵阵白烟冒出，面前的一排机器的显示灯慢慢走着进度，只听“噔噔噔”的声音响起，白烟停了下来，7台机器有两台显示红叉表示失败，其他五台显示成功，黑木的助手听着指令一个个打开复活机，第一个出来的是触手百合，出来后老老实实的呆在原地。工作人员抛出j-i,ng灵球收服了他，通过旁边的传送机传走。第二台机器打开出来的是头盖龙，叫了一声，气势汹涌的向这边冲来，源治放出七夕青鸟，一击冷冻光线冻住了头盖龙，头盖龙被收走。第三个出来的是闪光化石翼龙，力气很大，和七夕青鸟对撞在一起。
源治看到说：“这个十分不错。大吾，不要再看热闹了。”大吾放出了钢帝企鹅协助源治的七夕青鸟，由七夕青鸟拖住化石翼龙，钢帝企鹅使用水炮将其打败收服起来。
黑木看到后对源治说：“这个化石翼龙我记录完了的话，有需要的可以来研究所。”源治听了很不好意思：“这……十分感谢。”叶辉看到这知道了显然源治很喜欢化石翼龙，之前肯定是求了黑木博士其他事，现在很喜欢又不开口，黑木叔直接答应给他一只化石翼龙了。
等了一会，第四个出来的是特殊形态的化石翼龙，化石翼龙的身体是灰色的，翅膀上有部分是紫色的，原形与白垩纪的翼龙很像，它的爪子有四个。翅膀、身上、尾巴和头部围，看见特殊状态的化石翼龙，叶辉知道他是系统奖励的特殊化石，是永久的a状态的化石翼龙。
但其他人对他十分重视，源治和大吾分别放出了血翼飞龙和波士可多拉进行围攻。a化石翼龙不敌围攻，很快失去战斗能力被捕捉。最后出来的闪光化石盔看着周边的j-i,ng灵们，十分安静的呆在地上，被收服传送。
显然黑木的注意力已经被a化石翼龙吸引了全部注意力，打算研究新的课题。
距离复活化石的日子已经过了一个月，叶辉已经熟悉了全新的暮水镇。多了一个警署，j-i,ng灵中心建了二层，镇中组建了海上巡逻护卫队等等。
一个月的时间里，叶辉和黑木的其他助手一起帮忙整理资料，了解黑木研究所各个研究室的进度，复活化石j-i,ng灵的安排等等，闲暇时间里和大吾请教j-i,ng灵知识打指导站，当然叶辉是被指导的一方。
今天叶辉现在黑木的秘密研究所和黑木博士一起分类，除了叶辉拿回来的化石，还有黑木自己发布任务收集的，丰缘联盟提供化石样本，德文公司提供的化石收藏等。复活成功的j-i,ng灵以关东和丰缘地区的比较多，其他地区的仅仅有几个。叶辉接着黑木从各个档案中挑出的资料装袋。
收拾完后，两人来到了让化石神奇宝贝生活的溶洞，等到了龙天天源治和源漫。“您好，黑木博士，我是源漫，来挑选j-i,ng灵的。叶辉，好久不见。”源漫打招呼道。
黑木说：“和叶辉认识的话，让叶辉带你进去吧。”
叶辉和源漫边走边说：“你想要什么种类的j-i,ng灵呀？”“当然是龙系，龙系。爷爷欠了人情才让我来挑选的，要帮我挑只优秀的j-i,ng灵，就靠你了叶辉。”源漫拜托道。
叶辉带着源漫来到了宝宝暴龙的区域说：“就五只，你可以挑选了。”源漫凭自己的经验挑选出了两只，在其中犹豫不定，叶辉看源漫挑选出来的都是用完整化石复活的能力高的j-i,ng灵，说了一句：“如果想要下颚力量比较大的选右边的。”“谢谢了叶辉，我就要说的那个。”源漫说完伸出手，叶辉从仪器上输入选项滑工作证，指纹等一系列验证，仪器打开露出五个j-i,ng灵球，叶辉拿了中间的一个收起宝宝暴龙给了源漫。